Tuy là đèo ở vùng núi cận kề biển, nhưng sự phát triển hỗn loạn của lấn sông biển, khai thác than và gọt trọc đồi núi, xây dựng nhà phố... làm cho khi có mưa thì nước đổ nhanh xuống thung lũng song đường thoát hẹp, dẫn đến đoạn ở chân đèo cũng bị ngập lụt.

Ngày 21/07/2018 sự kiện "Ngập sâu tới hơn 1 m tại Đèo Bụt" được đăng tải, với nguyên nhân là do trận mưa kéo dài suốt từ tối ngày 20/7 đến sáng nay 21/7 với lưu lượng lớn tại vùng này làm giao thông tê liệt [5].

Ngập lụt tái diễn vào ngày 4/8/2018 dẫn đến chân dốc ngập sâu đến 1,5–2 m lần nữa gây giao thông tê liệt [6].